keskiviikko 1. maaliskuuta 2017

Esi-isän DNA:ta etsimässä - osa II

Muutaman päivän vanhempana ja kenties viisaampana DNA-opin polulla edellisen, aihepiirin avanneen blogiartikkelini jälkeen, jatkan pohdintojen ja havaintojen kirjaamista.

Esittelemääni Family Finderin MyOrigin karttaan liittyen avasin keskustelua Suomi DNA-projektin FB-ryhmässä. Kiitettävän vilkasta keskustelua herättäneestä mielipiteenvaihdosta voitaneen tehdä päätelmä, että kyseisen kartan osoittama alue on varsin karkea, jota grafiikkaa pitää lukea globaalimmalla tasolla. Kuten Esko Ranta kommentoi: "perimäkomponentin "Finland and Northern Siberia" suurimman prosentuaalisen esiintyvyyden alue.
Sen informaatiotarkkuus riittänee paremmin jenkkisiirtolaisen sukujuurien kartoittamiseen, kuin hämäläisten erottamiseen savolaisista juurista.

Toinen kysymyksiä itselläni herättänyt seikka, josta myös avasin e.m. ryhmässä, liittyi FF n.k. serkkutestin datan tuottamaan raporttiin Gedmatch sivustolla. Are your parents related? 
Minimum threshold size to be included in total = 700 SNPs
Minimum segment cM to be included in total = 7.0 cM
No shared DNA segments found
No indication that your parents are related.


Perinteinen sukututkimus kuitenkin osoittaa vanhempieni olevan sekä 4. että 6. serkut, jotka johtavat heidän eri vanhempiensa linjoista.
Mistä sitten tulokset johtuivat? Onko esivanhemmissa jollakin eri isä kuin mitä kirjoihin on merkitty (äiti lienee varmempi tapaus)?
Keskustelun johdattamana asiaan löytyy selitys, jota myös viestiketjussa päädyin kommentoimaan seuraavasti:
Lueskeltuani Ftdnan Learning Centerin FAQ:ta olen mahdollisesti päässyt samaan ymmärryksen alkuun, johon Heikki Qvist ja Annika Smeds viittasivat:
"The more generations there are between you and your cousin’s common ancestor, the more possible it is that you and your cousin did not inherit the same segment of DNA from your common ancestor. Inheritance is a random process and you may find that you do not share a detectable amount of DNA with a known 4th cousin, yet that you do share some DNA with your 5th to 8th cousins." 
4.serkut siis jakavat keskimäärin 0,195% DNA:sta, joka on kuitenkin sattumanvaraista määrän ja kombinaatioiden suhteen. Siten on mahdollista että heidän yhteiset juurensa eivät paljastu FF-testissä.
Lapsen tuloksissa voi olla mätsejä joita ei hänen vanhemmiltaan löydetä.
Jos nyt vielä oikein tulkitsen Gedmatchin tuloksia vanhempieni välisestä sukulaisuussuhteesta, niin voidaan sanoa että ko tulokset voivat vahvistaa mutta eivät sulje pois tällaisen sukulaisuuden olemassaoloa
.
Edellä olevassa on siten huomionarvoinen seikka tulkittaessa FamilyFinderin tuottamaa tietoa.
Alla on esitetty taulukko, joka osoittaa keskimääräisesti yhteisen DNA:n periytymisen jälkipolvien ketjussa. (kuvaa klikkaamalla suuremmaksi)

(https://www.familytreedna.com/learn/autosomal-ancestry/universal-dna-matching/percentage-common-ancestors-dna-share-cousin/)
Yksinkertaistettuna FTDNA:n Family Finder testi eli n.s. serkkutesti tutkii autosomaalista DNA:ta, joka periytyy molemmilta vanhemmilta. Sukulaisuutta ja sukulaisuuden astetta kahden yksilön välillä ilmaistaan yhteisten geenisegmenttien yhteispituudella sekä pisimmällä yhtenäisellä segmentillä. Segmenttien pituutta ilmaistaan centimorgan -yksiköllä (cM). Saadusta arvosta voidaan karkeasti arvioida sukulaisuuden aste.
Henkilön näytteestä luettu geenidata ajetaan vertailua varten FTDNA:n (tai esim. Gedmatch'in) tietokantaan. Analyysin tuloksena saadaan taulukko jossa voidaan tarkastella näin saatuja yksilöiden välisiä yhteneväisyyksiä, eli "mätsejä".
Esim. omassa FTDNA:n Family Finder Matches taulukossani on yli 2000 testin tehnyttä henkilöä eri asteisina mätseinä. Suurimmat arvot ovat 143 cM yhteisten jaettujen segmenttien pituus sekä pisin yhtäjaksoinen segmentti 15 cM. Näillä arvoilla FTDNA arvioi olevamme 2-3 serkukset.
Sikäli kuin (ja ehdottoman toivottavasti) kyseinen mätsi on jakanut perinteisen sukupuunsa, paikka- ja nimiesiintymät sekä yhteystietonsa, voimme mahdolisesti selvittää yhteiset esivanhempamme.

http://blog.kittycooper.com/2015/05/new-dna-relationship-statistics-from-blaine-bettinger/
Taulukossa suuntaa antavia cM-lukemia eri sukulaisuuksien tasoilla.

Tämä selvä tältä erää ja toistaiseksi... siirryn tutkailemaan X-DNA:n maailmaa (ellei jokin muu kiinnostava vie huomion sitä ennen). Huhtikuussa Sukututkimusseuran Genomitiedon iltakouluun tietoa kartuttamaan...

Joitakin FTDNA:n linkkejä aiheeseen:



Ei kommentteja:

Lähetä kommentti